¿Conocemos a todos los tipos de cáncer? Y qué decir de las causas o defectos genéticos que están subyacentes y que, quizás, tengan algo en común que pueda ser su Talón de Aquiles que tanto buscamos.
«Si utilizas al enemigo para derrotar al enemigo, serás poderoso en cualquier lugar a donde vayas» – El arte de la guerra – Sun Tzu.
Las alteraciones genéticas en diferentes tipos de células alrededor del cuerpo dan lugar a cientos de diferentes formas de cáncer. Los científicos están empezando a compilar catálogos de estas alteraciones genéticas, o biomarcadores, con el objetivo de que se puedan usar para diagnosticar y estadificar varios tipos de cáncer con sólo una muestra de sangre. Sin embargo, pocos de estos biomarcadores son comunes a muchos tipos diferentes de cáncer.
Ahora, un nuevo estudio realizado en Japón y Australia y publicado en Cancer Research ha identificado a un gran número de genes que están normalizados en muchos tipos diferentes de cáncer. La esperanza es que esto pueda dar lugar a pruebas de biomarcadores para la detección temprana y, por lo tanto, el tratamiento rápido del cáncer.
Cuando un gen se normaliza en el cáncer significa que en el gen está más altamente expresado en células cancerosas que en las células sanas. Un gen más altamente expresado tiene un efecto más fuerte – por ejemplo, si el gen se codifica para una proteína o enzima, entonces más de esa proteína o enzima será producida.
Los investigadores creen que la fuerza de su estudio viene del hecho de que utilizan dos tecnologías diferentes para encontrar los biomarcadores contenedores de cáncer.
En primer lugar, se utilizaron los datos obtenidos usando una tecnología llamada Análisis Cap de la expresión génica (CAGE) como parte del proyecto FANTOM. Aquí, se buscaron diferencias en la expresión génica en líneas celulares de cáncer 225 y 339 en células normales.
Luego, se analizaron los datos de secuenciación de 4.055 tumores primarios y 563 tejidos sanos de la (TCGA) Base de datos del Atlas de Genoma del Cáncer, y se comparan los dos resultados para buscar cambios genéticos comunes a ambos conjuntos de datos.
Estudio identifica 128 biomarcadores contenedores de cáncer
El primer autor Bogumil Kaczkowski, del Centro RIKEN de Ciencias de la Vida y Tecnologías en Japón, explica cómo utilizar los dos conjuntos de datos diferentes, lo que les permitió combinar sus fortalezas y compensar sus debilidades:
«Los datos TCGA se complican por el hecho de que las muestras de tumores se componen de una mezcla de diferentes células, mientras que los datos del conjunto FANTOM5 es a partir de células creadas en cultivo celular, donde los cambios pueden derivarse del proceso de cultivo. Al poner los dos juntos y mirando a los cambios que se han encontrado, hemos sido capaces de hacer un catálogo robusto «.
A partir del análisis, el equipo identificó 128 biomarcadores comunes a ambos conjuntos de datos, y que están presentes en una variedad de tipos de tumores.
Algunos de los biomarcadores ya son bien conocidos – como TOP2A y MKI67.
Pero el estudio también identifica una serie de nuevos marcadores, incluyendo cientos de promotores – partes del genoma que activan la expresión génica. También encontraron que un elemento poco conocido y repetitivo llamado REP522, parece estar dimensionado en muchos tipos de cáncer.
El co-autor Piero Carninci, también del Centro RIKEN de Life Technologies Ciencia y uno de los líderes del consorcio FANTOM5, concluye:
«Esperamos que los investigadores utilizen nuestros hallazgos para identificar marcadores para los tipos de cáncer de muchos, que en la actualidad no tienen marcadores útiles. También puede ser posible orientar los genes que hemos identificado como posibles objetivos de drogas. Estos objetivos podrían, potencialmente, ayudar a muchos pacientes de cáncer como que están regulados por incremento en muchos tipos diferentes de tumores «.
estudio de genes
